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多序列比对工具clustalx下载安装

时间:2020-04-12 14:25:12  作者:无名  浏览量:44

如何序列对比?ClustalX(序列对比软件)轻松帮助用户。用于多重比对不同物种的序列,以确定该序列与其它序列间的同源性大小,适用于对核酸与蛋白序列进行多序列比对。是生物学上用来研究分子序列的应用程序,在对核酸与蛋白序列进行多序列比对时就要用到它
多序列比对工具clustalx下载安装
clustalx下载安装图一
安装方法
1、下载解压文件,找到clustalx.msi双击安装
2、选择安装位置C:Program Files (x86)clustalclustalx
3、准备安装,点击install进入安装
4、安装完成
多序列比对工具clustalx下载安装
clustalx下载安装图二
例子说明
A、B、C三条序列比对。其实就是:A和B比;A和C比;B和C比
同理n条多序列比对就是做nC2次两序列比对,因此多序列比对的本质就是多次两条序列比对,也就是某条序列和其余的各个序列都进行一次比对.那么参数的设置当然就是设置两条序列比对时的规则就可以了.
Clustalx的多序列比对算法是基于双序列比对的,它先将所有序列两两比对,然后根据两两比对结果构建指导树,再根据指导树依次添加相似度最高的序列,直至全部序列都被加入.所以对双序列比对参数的设置是Clustalx进行多序列比对所必需的~
多序列比对工具clustalx下载安装
clustalx下载安装图三
常见问题
1,从网上看来说CLUSTALX软件使用的时候,开始要输入FASTA格式准备的DNA序列test.seq文件。请问这种文件怎么生成啊?记事本?
其实没有规定的文件名,不一定是叫test.seq,任何你想要的都可以,除了中文名(下面会说明)。主要里面的内容是正确的格式就行了~。Clustal支持的格式有多种,如NBRF/PIR,EMBL/SWISSPROT,Pearson (Fasta),Clustal (*.aln),GCG/MSF (Pileup),GCG9/RSF and GDE等
2,什么使用ClustalX时,总是导入不了序列,出现 ERROR:Can not open output file??
这个问题挺多人碰到过的~这是因为你导入的文件的路径包含有中文名。把文件放在其它地方看看。最好路径也不要有空格了。当然前提是你的格式要正确了。这个问题同样适用于ClustalW或其它dos类的软件
3,ClustalX比对后的结果中.aln文件是什么?
这个是序列比对结果的文件。关于这部分,你可以看如何把clusterX的结果转为漂亮的图片
4,ClustalX比对后的结果中.dnd文件是什么?
这个文件是系统进化树文件,需要装TreeView软件才能看(用Dnaman也可以的),进化树显示工具TreeView的下载

ClustalX 1.83 官方版

ClustalX图片
  • 软件性质:国外软件
  • 授权方式:免费版
  • 软件语言:英文
  • 软件大小:502 KB
  • 下载次数:1097 次
  • 更新时间:2020/4/11 1:25:11
  • 运行平台:WinXP,Win7,...
  • 软件描述:CulsTAL X是CulsSTW多序列比对程序的Windows接口。它提供了用... [立即下载]

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